故事发生在位于旧金山的普西迪基地，这是一座拥有着212年漫长历史的军事基地。一名女警的尸体在这里被人发现，旧金山警探杰伊（马克·哈蒙 Mark Harmon 饰）负责调查此案，让杰伊非常不爽的是，他的搭档是名叫阿兰（肖恩·康纳利 Sean Connery 饰）的男人，阿兰曾经是杰伊服役期间的长官，两人的性格针锋相对，一直互相不对付。更糟的是，杰伊爱上了阿兰的女儿唐娜（梅格·瑞恩 Meg Ryan 饰），这令两人之间的关系雪上加霜。 随着调查的深入，杰伊发现案情并不是他想象的那么简单，想要逮捕幕后的凶手，他和阿兰必须尽释前嫌携手合作，而他们所要面对的凶手也异常的强大和危险。军中迷案。
